普洱茶是一种耐贮藏的茶，贮藏是重要的加工工序，不合理的贮藏方式会造成普洱茶品质降低。
普洱茶与绿茶、乌龙茶、红茶的贮藏不同之处在于，普洱茶贮藏需要微生物、酶、湿热、氧化等综合作用完成后续加工，所以普洱茶不能低温、除氧贮藏，贮藏用的包装宜选用透气性好的材料。
普洱茶陈化品质的变化与贮藏温度、时间、含水量存在极显著的相关性，微生物在普洱茶的陈化过程中也起到了正效应作用，微生物生命活动和代谢产物是普洱茶品质形成的重要因子，对普洱茶的甘滑、醇厚、活顺、陈香等品质特点的形成有重要作用。
包材与氧气普洱茶贮藏需要微生物、酶、湿热、氧化等综合作用完成后续加工，所以普洱茶不能低温、除氧贮藏，贮藏用的包装宜选用透气性好的材料。
为了提供适量的氧气，普洱茶贮藏室宜通风，但空气流速不能过快，以免造成普洱茶味道寡淡、香气散失、茶饼颜色深黑。
光照
由于光照条件下的氨基酸、咖啡碱、茶多酚的含量较避光的分别低6%、3%、7%，且光照下贮藏普洱茶，会加速茶叶的褐化。因此，普洱茶需要避光贮藏，长期暴晒的茶叶会有锁喉感，有油烟味，苦味重。
温度与湿度
邢倩倩等提倡，温度保持在25℃左右,平均湿度控制在75%以下才能形成良好的普洱茶品质。而温度平均在28℃以上，不利于普洱茶品质形成。
不同贮存温度导致普洱茶风味不一样，常温以陈香型为主，37℃前期以陈香型为主，后期则出现甜香，55℃贮存则先期出现枣香风味，但时间太长则会出现酸馊味，导致品质下降。
汪研究表明，常温和45℃贮藏对熟饼和散茶有利，香味明显，而25和35℃贮藏对其不利，易发霉。
时间
时间因素对普洱茶贮藏过程中化学成分变化影响是要高于温度因素影响。
根据普洱茶国标GB/T22111—2008，普洱茶在合理的贮藏环境中，可长期保存。普洱茶需要长时间的储存(10年或10年以上)发酵来强化滋味和香气。
普洱生茶由于没有渥堆工艺自然陈化耗时长，陈化10～20年为佳;
普洱熟茶因有渥堆工序，一般贮藏3～5年为佳。
但普洱茶的贮藏时间不是越长越好，无论是生普还是熟普都有一个最佳时期，在这个时期以前，其品质呈上升趋势，达到高峰，此后再继续贮藏，品质就会逐渐下降。
在贮藏过程中，如果贮藏的环境受到了污染，就应立即更换贮藏地，或者停止贮藏;普洱茶的色、香、味达到了最佳状态时，便没必要再继续贮藏了，因此
普洱茶贮藏期难以规范。
茶叶含水量
水分含量对普洱茶的陈化品质影响较大。茶叶吸湿的快慢，不仅与周围环境相对湿度有关，还与茶叶本身的初始含水量有关，初始含水量低的茶叶吸湿速度和吸湿量均大于初始含水量高者。沈丽萍等研究表明，高温、低水分是普洱茶贮藏的较好条件，能够保持茶叶色泽和香味，而低温和高水分则会加速普洱茶发霉。
龚淑英等研究表明，成品普洱茶贮藏时的含水量掌握在9%左右，最有利于普洱茶品质风格的形成。
贮藏过程中，茶叶含水量变化呈曲线上升趋势，并且增速先快后慢，不同厂家出厂的普洱茶水分含量有差别，产品不同、贮藏环境不同，普洱茶产品贮藏水分含量难以规范。
部分文字参考《普洱茶滋味成分及其与品质的关系》、范晓伟《普洱生茶加工过程中的品质相关化学成分研究》