在保存毛蟹茶的过程中，需要格外关注周围环境因素，因为温湿度、氧气含量和光线强弱等都会影响茶叶的质变速度。因此，在储存茶叶时，必须严格控制这些环境条件。
专家指出，理想的储存条件是：
低温：实验表明，每升高10摄氏度温度，茶叶褐变速度就会增加3到5倍。在-10摄氏度以下，可以抑制褐变；在-20摄氏度以下贮存几乎能完全防止变质，有条件的情况下使用冷藏也是一个好的选择。大型茶企通常会采用这种方法在门店中保存茶叶。
干燥：如果毛蟹茶没有防潮包装或者环境相对湿度很大，那么周围环境中的湿度会导致茶叶含水量上升。如果发酵后含水量超过5%，则可见明显的变质，因此储存时应保持干燥，最好相对湿度控制在20%以下，以确保茶叶含水量始终维持在6%左右。如果可以的话，更小的相对湿度将更有利。另外，在贮存前应该测定并调整掉过高的含水量，如果太高，可进行复火处理，或用生石灰吸收多余的水分，即使需要更换几次，也要确保包含水量降至6%以内，这样就可以直接研磨成粉末再进行储存。
无氧气：空气中约有21%氧气，而许多物质都可能自行发生氧化反应。因此，无氧条件可以有效阻止这一变化。目前使用真空包装或抽去空气充氮包装就是基于这个原理。
不透光：光照能够促进植物色素及类脂物质氧化，即使是在低温和无氧条件下，一旦受到强烈阳光照射，也会使得颜色出现劣化，并产生日晒味道。因此，包装材料不宜为透明袋，不要将毛蟹放置于直射阳光的地方。而对于一些小型包装，用防潮袋加盖一层厚纸盒既能起到防护作用又能美观。但是，这样的设计实际上并不利于品质保证。
无异味：毛蟹茶具有很强吸附力，因此切勿与其他物品共处，而且储存在容器场所也必须无异味。一旦与其它带有特殊香味的事物接触，就可能导致整个批次失效。