祁门红茶的制作工艺精湛，分为初制与精制两大阶段。初制奠定品质基础，而精制则将毛茶转化为上乘品。初制四道工序，精制十几道工序，经过近十个级别和几十种花色，每一环节都需不懈重复、倾心致力，为其他工夫红茶所难以匹敌，因此祁门红茶又被称作“祁门工夫红茶”，更是中国工夫红茶的代表。
采摘
祁门红茶采摘通常在春夏季节进行，最理想的是清明后至谷雨前。这时期，新芽叶最嫩最美。曾经，只有用于加工高级黑绿白三等级的“三等级”；近年来，还开始生产如“云雾峰”、“香螺峰”的花香型普洱，以单一或双片新芽著称。
萎凋
采集后的鲜叶首先经历萎凋，即通过摊晾使其水分均匀散失，使叶片变软干燥。
揉捻
在萎凋之后，便进入揉捻过程，将萎凋后的叶子搓揉成条状，让细胞破碎，与空气中的氧气接触促进酶促氧化，同时形成独特香气。
发酵
发酵是形成高品质祁门红茶关键步骤，是从绿色到赤色的决定性过程。在发酵中，各种化学反应发生，使得香味丰富多样。
烘干
最后一步是烘干，将发酵好的毛茶用高温烘焙以终止发酵、除去多余水分，并发展香气。在这个过程中，不仅控制了温度，还巧妙地释放出了青草气体、蜜糖香以及果实花朵的芳醇芬芳，这些都是祁门红 tea 独有的特色之一。
经过初次处理后的毛茸 茶即成为名为“金黄丝绒”的产品。而再进一步精心打磨，则可达到真正意义上的艺术品——那就是所谓的“纯正普洱”。此类普洱在中国乃至世界范围内享有极高声誉，被认为是所有普洱之中最费心劳力的，也是其中最高端且难度最大的一种。此外，它还因为其独特的手法而闻名遐迩，更被誉为中国工夫普洱之冠。