祁门红茶的制作工艺精湛，分为初制与精制两大阶段。初制奠定品质基础，而精制则将毛茶转化为上乘品。初制四道工序，精制十几道工序，近十个级别、几十种花色，每一步都极尽考究，为其他红茶所难以比拟，因此祁门红茶又称“祁门工夫红茶”，被誉为中国工夫红茶的代表。

采摘是春夏两季，最佳时间在农历清明后至谷雨前，当时芽叶最嫩最美。以前主要用于加工工夫红茶，现在还生产花香型如红毛峰、红香螺等，以早春采一芽一叶甚至单芽更受欢迎。

萎凋是将鲜叶摊晾，使水分均匀散失，让叶片凋谢，为后续过程打下基础。

揉捻使鲜叶像揉面搓揉形成条状，破碎细胞让多酚与空气接触发生氧化，为发酵打基础，同时影响香气形成。

发酵是关键步骤，将绿色变成深色，并形成特有的香味，是决定性过程之一。

烘干终止发酵防止过度，有利于保存和发展香气，在高温下散发出青草气、蜜糖气和果花香气，是祁门特色的三重境界。

经过初制成为紅毛茶，再经精制成为商品品，这其中尤其耗费巨大的功夫，因此称作“祁门工夫紅茶”。

精制含有16道手工作业，其中筛分、打袋、风选拣剔补火官堆等手动操作，对每一个细节要求极高，如筛分需端平晃动不倾斜；打袋需掌握力度次数；风选用木质风扇反复操作；撼盘轻飘筛除轻质黄片；拣剔女工挑选杂物；拼配老师傅按比例合并不同号头以保证传统正宗品质特点；补火对火候严格掌握发展香气改善品质；官堆通过木齿梳耙混合均匀装箱完成。