苦丁茶的适用须谨慎，尤其在冬春交替之际，当寒气渐浓，风寒感冒易发时，饮用苦丁茶反而不利于病情的缓解。对于体质虚弱者，如常感手脚不温、畏寒怕冷的人群，他们应以温性食物为主，如羊肉、狗肉等，以补养阳气，而非长期摄取凉性的苦丁茶，这样有助于抵御寒邪。
慢性胃肠炎患者更应小心，不宜饮用苦丁茶，因为这类疾病往往伴随脾胃虚寒，一旦腹部受凉或食入凉性食品，便易引起腹痛腹泻。此外，对于脾胃功能较差的老年人以及尚未健全脾胃功能的婴幼儿来说，过多摄入苦丁茶同样可能导致消化不良、饥饿便溏等问题。
此外，对于经期女性和新生母亲也不宜轻易饮用苦丁茶。月经期间身体处于疲弱状态，若再加上咖啡因含量高的苦丁茶，其对身体影响可谓两重打击：一方面容易造成血液凝固，使得月经排出受阻；另一方面则会损伤脾胃，加剧体内寒邪，从而导致痛经或其他症状。而产后女性由于身心俱疲，更需避免这种“阴中之阴”的饮品，以免妨碍子宫恢复和影响后续健康。
最后，由于久服咖啡因含量较高的药材对男女生育都有一定的副作用，因此建议长期消费者注意调整饮用频率，或选择其他温和且适合自身体质的一些植物制剂。