普洱茶中的咖啡因含量相对较高，长期大量饮用可能导致睡眠障碍。普洱茶中的咖啡因能够刺激大脑，使人感觉精神充沛，但如果在日常生活中过度摄入，会影响人的睡眠质量。尤其是在傍晚时分或夜间饮用普洱茶，更容易引起失眠和不安，这是因为咖啡因可以抑制体内某些调节睡眠的化学物质，如腺苷。
对于有消化系统疾病的人来说，普洱茶可能不适合长期食用。由于普洱茶中的酚类物质含量较高，这种物质对于肠道黏膜有一定的刺激作用，对于胃溃疡、十二指肠溃疡等患者可能会加重症状。此外，腹泻、便秘等消化不良现象也可能随之出现。
长期饮用普洱茶还存在增加胆固醇和血糖的问题。研究表明，一些类型的绿色植物性提取物（如来自一些花卉、草本植物和树叶的提取物）可以阻断小肠对淀粉分解产生的葡萄糖吸收，从而降低血糖水平。但这并不是所有人都适宜的选择，有些人通过改善食谱来控制血糖水平才是更为安全有效的手段。而且，如果身体内部存在一定程度的脂肪代谢问题，那么过多摄入这些提取物也许会使得身体更加难以处理脂肪，从而导致更多健康问题。
尽管普洱茶富含抗氧化剂，可以帮助抵御自由基损伤，但它同样具有潜在的心脏风险。如果心脏病史或者其他心脏疾病，则应谨慎消费或完全避免此类产品。此外，由于部分抗氧化剂与维生素C一起使用时效果最佳，因此建议与医师讨论是否需要补充其他营养品，以达到最佳效益，同时确保不会产生负面反应。
对于女性而言，怀孕期间应该非常谨慎地摄入任何形式的植物提取物，因为它们对胎儿成长发育仍然是一个未知领域。一旦怀孕后，最好咨询医生意见，并根据专业建议进行调整。在哺乳期，也应注意监测婴儿是否出现异常反应，因为某些成分可能通过母乳传递给婴儿。
