过量摄入维生素和矿物质
保健茶中常含有高浓度的维生素和矿物质，长期或过量饮用可能导致体内这些营养素超载。例如，铁分子的摄入过多会引起铁盈血症，出现头晕、恶心等不适症状；而维生素C的过量则可能增加尿酸排泄，从而加剧痛风病情。此外，一些保健茶中的金属元素，如铅、汞等，对人体健康构成严重威胁。
影响药物作用
一些保健茶中的成分与服用的药物相互作用，改变药效或增强副作用。比如某些抗凝剂（如华法林）与草本植物紫石英相互作用，可增加出血风险。而且，这类产品往往缺乏科学验证，不明确其与特定疾病治疗之间的安全性和有效性。
干扰内分泌系统
保健茶中的植物化学成分可能干扰正常的人体内分泌系统功能。例如，有研究表明某些草本植物可以模仿激素在细胞内工作，因此在使用时应谨慎，以免影响女性荷尔蒙水平或男性睾酮水平，从而引发各种健康问题。
刺激消化道反应
不少保健茶中含有的香料和其他调味剂可刺激胃肠道黏膜，使得消化不良、腹痛甚至食欲减退成为常见现象。此外，由于个体差异，一些人对这些刺激因子特别敏感，将导致更为严重的情况。
潜在的心理依赖
长期依赖于某种特定的“神奇”保健方法，而忽视了基本健康习惯，如均衡饮食、规律运动等，这对于预防慢性疾病是非常重要的。如果人们将注意力集中在补充一种特定的补品上，而不是从根本解决问题，那么这种心理依赖就有可能损害他们对整体健康管理的理解和实践能力。